生物数据分析技能实训班 - 浙江大学邮件系统.doc
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生物数据分析技能实训班 - 浙江大学邮件系统.doc
- 1 -关于举办关于举办生物信息数据分析技能培训班生物信息数据分析技能培训班的通知的通知各有关高校及相关科研单位:各有关高校及相关科研单位:当前生物学及医学研究与生物信息学已成为密不可分的有机整体,从科研选题、实验方案设计到实验结果分析,生物信息学贯穿始终。浙江省生物信息学学会应浙江省科协委托,推出生物信息数据分析技能培训班,特邀学会理事长浙江大学陈铭教授及其团队担任主讲教师。授课内容着力于以解决实际问题为导向,手把手教授生物信息数据分析的各项技能。课程将理论授课与上机实践有机融合,指导学员将各项技能融会贯通,真正掌握相关的生物信息学基本方法与常用工具,力求学有所用、学有所值。主办单位主办单位:浙江省生物信息学学会协办单位协办单位: 浙江大学国家级生物实验教学示范中心培训地点培训地点:浙江大学国家级生物实验教学示范中心 210 生物信息学实验室(紫金港校区)培训时间:培训时间:2015 年 5 月 3 日至 8 日注册方式注册方式:注册费学员可根据自身情况按阶段自主选择培训内容(见培训日程): 课程 A(5 月 3 日至 8 日) 3000 元/人,同一单位三人以上参会优惠至 2500 元/人。课程 B(5 月 5 日至 8 日) 2500 元/人,同一单位三人以上参会优惠至 2000 元/人。以上课程,学会会员可减免 200 元。每阶段课程招生人数限 40 人,按交费先后顺序确定座位号。住宿统一安排在紫金港附近酒店,费用自理。培训期间提供午餐,晚餐自理。缴费方式(指定账号)账户名称:浙江省生物信息学学会账 户 号:交通银行西湖支行 开 户 行: 331066130018170122500汇款用途处写明:生物数据分析技能实训班 ;姓名联系人及 E-mail:姓 名:徐程 xuc123zju.edu.cn; 斯舒平 sspingzju.edu.cn ;沈小仙280681158qq.com填写报名表并于报到前发送至联系人 E-mail,上机实践可自带笔记本电脑。如有其它要求,请在备- 2 -注中说明。生物信息数据分析技能培训班生物信息数据分析技能培训班培训日程安排表培训日程安排表日期日期时间时间授课题目授课题目 主讲主讲授课内容授课内容 5 月 2 日10:00-18:00报到 08:00-09:00调试网络;预装软件参加课程 A 的学员09:00-10:30生物信息学数据分析概论;重要生物数据库 10:45-11:45生物文献搜索与文献分析5 月 3 日 第一天 14:00-17:00生物信息学基础 上机实践:生物数据库检索;文献数据库检索与文献分析 08:30-10:00Linux 系统、命令、操作 & 上机实践 10:15-11:30Perl 语言基础与介绍 & 上机实践 I 14:00-15:00上机实践:Perl 上机实践 II; 15:15-17:00计算机技能R 语言基础介绍 & 上机实践(R 解决生物信息学问题实例)5 月 4 日 第二天下午报到参加课程 B 的学员08:30-10:00核酸序列分析概论;公共资源预测序列功能; 包括:序列 相似性查询;cDNA 及基因组参考序列的获取;常见序列格式 的释义与转换;开放阅读框的预测;启动子区域的预测;内 含子剪切位点的识别等等。10:15-11:30进化分析;系统发育学;包括:进化距离的计算;进化速率 的分子钟检验;系统进化树的构建。5 月 5 日 第三天14:00-17:00序列分析上机实践:单机版 Blast、ClustalW 等序列分析软件使用; 常见进化分析软件使用(MEGA 等) 08:30-10:00高通量测序技术介绍;常见软件和分析流程 10:15-11:30上机实践:二代测序软件使用示范;5 月 6 日 第四天14:00-17:00NGS 数据分析 测序公司结果报告解读及后续分析 08:30-09:30转录组学基本概况和技术发展介绍09:45-11:30转录组定量分析介绍 & 上机实践(数据获取、质量控制、 表达量计算)5 月 7 日 第五天 14:00-17:00转录组数据分析 上机实践:转录组数据分析及实践(差异表达基因筛选、聚 类分析、GO 功能注释、代谢通路分析,ncRNA 分析等) 08:30-10:00系统生物学基础及合成生物学介绍10:15-11:30重要通路数据库及网络可视化软件(Cytoscape 软件)的介 绍5 月 8 日 第六天 14:00-17:00系统生物学分析 上机实践:应用 Cytoscape 软件进行基因注释、基因表达及 分子间相互作用分析生物信息数据分析技能培训班生物信息数据分析技能培训班报名表报名表序序 号号姓名姓名性性 别别职称职称单位名称单位名称专业专业手机手机/E-mail报名报名 科目科目123- 3 -备注: 1、是否统一安排食宿(费用自理): 是 否 2、其他