生物资讯学的发展.ppt
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1、1-,1,Chapter7Bioinformatics,1-,2,生物資訊學的發展,1990年代:人類基因體計劃1982年:美國國家衛生院(NIH)建立了GenBank1988年:建立NCBI(NationalCenterforBiotechnologyInformation),1-,3,DefinitionofBioinformatics,Research,development,orapplicationofcomputationaltoolsandapproachesforexpandingtheuseofbiological,medical,behavioralorhealthdata
2、includingthosetoacquire,store,organizearchive,analyze,orvisualizesuchdata.,1-,4,1-,5,Whyusebioinformatics?,anexplosivegrowthintheamountofbiologicalinformationamoreglobalperspectiveinexperimentaldesign.data-mining-theprocessbywhichtestablehypothesesaregeneratedregardingthefunctionorstructureofageneor
3、proteinofinterestbyidentifyingsimilarsequencesinbettercharacterizedorganisms.Fromhttp:/www.ncbi.nlm.nih.gov,1-,6,生物資訊分類,生物資訊可略分為四類:有關生物之結構、形態、顏色等巨觀及微觀之資訊生物遺傳物質DNA及基因體序列及其特性的資訊生物大分子如蛋白質及碳水化合物結構與特性之資訊其他有關生物之生化、生理、遺傳、演化等之特性,1-,7,Typesofbioinformaticstools,DatabaseSoftwareWebresource,演算法圖像及訊號處理電腦架構及資料庫管
4、理電腦語言程式設計人工智慧及訊息理論設計與模擬作業數值分析統計學軟體工程及自動化,1-,8,主要生物資訊網站,NCBI(NationalCenterforBiotechnologyInformation)ExPASy(ExpertProteinAnalysisSystem)EMBnet(EuropeanMolecularBiologynetwork),1-,9,主要的核酸與蛋白質資料庫,GenBank(美國),EMBL(歐洲)及DDBJ(日本)PDB/RCSB(ProteinDatabase),PIR(ProteinInformationResource),Pfam(ProteinFamily
5、database),1-,10,1-,11,解析生物資訊之網路工作站,EMBOSS(EuropeanMolecularBiologyOpenSoftwareSuite)SDSC-BiologyWorkbench,1-,12,生物資訊學之應用,(1)數據取得及處理(2)基因定位(3)基因體圖譜及比較(4)分子模型構築及模擬(5)DNA及蛋白質序列及結構比較(6)大分子結構預測及藥物設計(7)分子演化等領域。,1-,13,1-,14,1-,15,1-,16,DNASequencing,AcquireSampleinformation,chromatograms,assembleddataStore
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