《海藻技术》PPT课件.ppt
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1、藻类基因组藻类基因组藻类基因组藻类基因组学研究进展学研究进展学研究进展学研究进展 藻类是最简单的植物,结构简单,无根、茎、叶分化,一般都具有进行光合作用的色素,属于自养植物。藻类包含原核的蓝藻如原绿藻,真核的红藻、绿藻、褐藻等。藻类植物跨越了原核和真核两界,对于了解生物起源、演化及机制意义重大,是生物学家共同关注的热点之一。基因组是全体基因的总和.其研究目标是破译生物的遗传信息,建立完整的遗传信息数据库,只有研究生物的基因组,才能最终阐明生物遗传和生命现象的奥秘.前言基因组学研究方法 绘制遗传图谱和物理图谱 AFLP,SSR等分子标记促进绘制高精度遗传图谱 DNA测序技术和计算机序列分析随着分
2、子生物技术的发展,越来越多的物种包括藻类被不同程度地测序:基因组测序和EST;建立了基因文库中心 (Gen Bank)贮存、分析、处理各种生物的DNA序列、遗传图谱完成测序的藻完成测序的藻红藻红藻(Cyanidioschyzon merolae);集胞藻集胞藻(Synechocystis sp.PCC6803););鱼腥藻鱼腥藻(Anabaenasp.pCC7120);聚球藻聚球藻(Synechococcus sp.WH8120);嗜热聚球藻嗜热聚球藻(Thermosynechococcus elongates BP-1);胶菌藻胶菌藻(Gloeobacter violaceus PCC742
3、1);原绿藻原绿藻(prochlorococcus marinusMED4;P.marinusMIT9313P.marinusCCMP1375;P.marinusCCMP1986;P.marinusSAR-1)绿藻绿藻 (莱茵衣藻莱茵衣藻Chlamydomonas reinhardtii)、强壮团藻强壮团藻Volvox carteri、古老的,最小的藻古老的,最小的藻 (Ostreococcustauri、Ostreococcus lucimarinus)小球藻小球藻Chlorella NC64A。硅藻硅藻(海链藻海链藻Thalassiosira pseudonana;三角褐指藻三角褐指藻 P
4、haeodactylum tricornutum)。基因组测序基因组测序正在进行基因组测序正在进行基因组测序,包括包括 Alexandrium tamarense;Amphidinium operculatum;Aureococcus anophagefferens;Chlorella vulgaris等藻。等藻。在藻类中除了在藻类中除了基因组基因组序列之外序列之外,还有大量的还有大量的表达序列标签表达序列标签(EST)已被测序已被测序,这些序列可从这些序列可从NCB I网站网站 EST 数据库获得。数据库获得。EST数据来自硅数据来自硅藻、绿藻、红藻、褐藻、金藻和腰鞭毛虫藻、绿藻、红藻、褐藻
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