pubmed检索教程.ppt
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1、美国医学文献数据库2013.42023/2/2复旦大学图书馆文献检索教研室1一、数据库概况一、数据库概况(一)编制单位:美国国立医学图书馆(NLM)(二)收录学科内容:主要收录生物医学、卫生保健以及生命科学相关文献。包括行为科学、健康专业所需要的化学、生物工艺学、基础研究;临床、护理、公共卫生、卫生政策发展或相关教育活动的内容。2000年起增加了生物、环境科学、海洋生物、植物和动物学、生物物理学和生物化学等生命科学方面的研究内容。2023/2/2复旦大学图书馆文献检索教研室2一、数据库概况一、数据库概况(三)文献来源:70多个国家和地区;近5000种生物医学期刊美国卫生研究院文献选择技术评估委
2、员会Literature Selection Technical Review Committee(LSTRC)评估挑选NLM和各专业协会的数据协作采集专家推荐。近年数据涉及37种语种,回溯至1949年的数据涉及60种语种。47%为美国本土出版文献,90%为英文文献,79%的文献有文摘。(以上由2009年7月数据库提供)2023/2/2复旦大学图书馆文献检索教研室3二、二、MEDLINEMEDLINE的检索平台的检索平台广域网免费平台:广域网免费平台:NCBI-PubMedNCBI-PubMed(含非(含非MEDLINEMEDLINE数据)数据)2023/2/2复旦大学图书馆文献检索教研室4二
3、、二、MEDLINEMEDLINE的检索平台的检索平台校园网内可用平台(校园网内可用平台(IPIP控制)控制)Ovid SPOvid SPWeb of KnowledgeWeb of KnowledgeEBSCOEBSCOOCLC First SearchOCLC First Search2023/2/2复旦大学图书馆文献检索教研室5校园网内可用平台的校园网内可用平台的MedlineMedline2023/2/2复旦大学图书馆文献检索教研室6PubMedPubMed数据库数据库http:/www.pubmed.govhttp:/www.pubmed.gov2023/2/2复旦大学图书馆文献检索
4、教研室7一、一、PubMedPubMed简介简介开发机构:开发机构:NCBINCBI(美国国立生物技术信息中心)(美国国立生物技术信息中心)http:/www.ncbi.nlm.nih.gov http:/www.ncbi.nlm.nih.gov 任务任务:利用计算机信息处理技术,建立分子生物学、生物化利用计算机信息处理技术,建立分子生物学、生物化学、遗传学知识的自动存储和分析系统,并开展相关学、遗传学知识的自动存储和分析系统,并开展相关先进方法的研究。先进方法的研究。促进生物技术研究者和医药治疗人员对数据库和软件促进生物技术研究者和医药治疗人员对数据库和软件的使用。的使用。促进全世界范围内生
5、物技术信息收集的合作。促进全世界范围内生物技术信息收集的合作。2023/2/2复旦大学图书馆文献检索教研室8NCBINCBI网站网站2023/2/2复旦大学图书馆文献检索教研室9NCBINCBI提供的数据库提供的数据库检索大分子生物学数据检索大分子生物学数据获取获取GenBank,EMBLGenBank,EMBL等数据库的核酸序列;等数据库的核酸序列;获获取取Swiss-port,PIR,PRF,PDBSwiss-port,PIR,PRF,PDB等等蛋蛋白白质质序序列列,从核酸序列翻译到蛋白质的序列;从核酸序列翻译到蛋白质的序列;获获取取基基因因和和染染色色体体图图谱谱;蛋蛋白白质质三三维维结
6、结构构数数据据及及大大分分子子模模式式(MMDBMMDB)等等其其他他生生物物信信息息数数据据库检索。库检索。PubMedPubMed等文献数据。等文献数据。2023/2/2复旦大学图书馆文献检索教研室10(二)(二)PubMedPubMed的特点的特点广域网免费提供题录和文摘广域网免费提供题录和文摘提供与原文的网址链接提供与原文的网址链接(部分免费获取)部分免费获取)提供检索词智能转换匹配提供检索词智能转换匹配界面简洁,操作简便界面简洁,操作简便(须须IE7.0IE7.0以上版本以上版本)2023/2/2复旦大学图书馆文献检索教研室11(三)(三)PubMedPubMed收录数据收录数据ME
7、DLINE IndexedMEDLINE Indexed1966 to prensent 1966 to prensent 的的MEDLINEMEDLINE已标引数据,有已标引数据,有MeSHMeSH字字段和摘要,每条记录标有:段和摘要,每条记录标有:PubMed-indexed for MEDLINEPubMed-indexed for MEDLINE OldMEDLINEOldMEDLINE1949-19651949-1965年间的年间的MEDLINEMEDLINE数据,无数据,无MeSHMeSH字段和摘要,字段和摘要,每条记录标有:每条记录标有:PubMed-OLDMEDLINE for
8、 Pre1966PubMed-OLDMEDLINE for Pre1966 2023/2/2复旦大学图书馆文献检索教研室12(三)(三)PubMedPubMed收录数据收录数据MEDLINE InprocessMEDLINE Inprocess最新的最新的MEDLINEMEDLINE处理中数据,未标引,无处理中数据,未标引,无MeSHMeSH字段。字段。每条记录标有:每条记录标有:PubMed-in processPubMed-in process。Publisher-SuppliedPublisher-Supplied出版商提供的电子文献题录,每条记录标有出版商提供的电子文献题录,每条记录标
9、有:PubMed-as supplied by publisher PubMed-as supplied by publisher,分为两类:,分为两类:MEDLINE MEDLINE 收录,逐步转为收录,逐步转为In Process,IndexedIn Process,Indexed状态。状态。Not MEDLINENot MEDLINE:PubMed PubMed 收录,收录,MEDLINEMEDLINE不收录,一不收录,一直标注直标注PubMed-as supplied by publisherPubMed-as supplied by publisher或或PubMedPubMed20
10、23/2/2复旦大学图书馆文献检索教研室13二、二、PubMedPubMed的检索功能的检索功能2023/2/2复旦大学图书馆文献检索教研室14基本检索输入框基本检索输入框高级检索高级检索检索指南检索指南检索工具:检索工具:特定文献检索特定文献检索临床查询临床查询专题查询专题查询其他资源:其他资源:规范词数据库规范词数据库期刊数据库期刊数据库临床试验等临床试验等个人空间个人空间2023/2/2复旦大学图书馆文献检索教研室15检检索索栏栏可可输输入入一一个个或或多多个个检检索索词词(系系统统默默认认空空格格为为ANDAND检索)检索)如:如:stroke thrombolysisstroke t
11、hrombolysis(中风与溶栓)(中风与溶栓)三、三、PubMed 基本检索规则基本检索规则2023/2/2复旦大学图书馆文献检索教研室16检检索索栏栏可可输输入入布布尔尔逻逻辑辑运运算算式式:(运运算算符符须须大大写写)如如:asthma AND(therapy OR treatment)asthma AND(therapy OR treatment)字段限定符:字段限定符:,空格按词组匹配,空格按词组匹配试比较试比较:stroke AND thrombolysisti stroke AND thrombolysisti stroke thrombolysisti stroke thro
12、mbolysisti stroketi stroketi AND thrombolysisti AND thrombolysisti stroketi stroketi thrombolysistithrombolysisti 三、三、PubMed 基本检索规则基本检索规则著者检索:姓全称在前,名首字母在后,著者检索:姓全称在前,名首字母在后,auau。如如:smith abau :smith abau “paulsen epaulsen e”auau思考题:中国学者的名字该如何转换呢?思考题:中国学者的名字该如何转换呢?如:如:闻玉梅闻玉梅 卢正宏卢正宏2023/2/2复旦大学图书馆文献检索
13、教研室17三、三、PubMed 基本检索规则基本检索规则2023/2/2复旦大学图书馆文献检索教研室18刊名检索:全称或刊名检索:全称或MEDLINEMEDLINE认可的标准缩写认可的标准缩写,so,so如:如:Journal of investigative dermatologysoJournal of investigative dermatologyso J invest dermatolso J invest dermatolso三、三、PubMed 基本检索规则基本检索规则输入刊名检索发表在该刊上输入刊名检索发表在该刊上的文献(限定出处字段的文献(限定出处字段SO)PubMedPu
14、bMed记录字段说明记录字段说明2023/2/2复旦大学图书馆文献检索教研室19文摘文摘第一著者单位地址第一著者单位地址出版商提供文献识别号出版商提供文献识别号著者群著者群版权说明版权说明参考评论文献参考评论文献合著者合著者文献参考评论文献参考评论定稿版定稿版校样版校样版输入日期输入日期输入完成日期输入完成日期电子出版日期电子出版日期2023/2/2复旦大学图书馆文献检索教研室20电子出版日期电子出版日期文献出版日期文献出版日期数据加入数据加入PubMed日期日期文献勘误文献勘误参考文献勘误参考文献勘误全部著者姓名全部著者姓名全部调研者姓名全部调研者姓名作为文章主题的著者全称作为文章主题的著者
15、全称文献相关注释文献相关注释基金编号基金编号基因符号基因符号期编号期编号资助调研者资助调研者资助调研单位资助调研单位国际标准期刊号国际标准期刊号美国立医学图书馆识别号美国立医学图书馆识别号期刊全称期刊全称2023/2/2复旦大学图书馆文献检索教研室21最后修订日期最后修订日期规范词表词规范词表词规范词确立日期规范词确立日期系统组织的文摘系统组织的文摘版权拥有者版权拥有者题录提供机构的识别号题录提供机构的识别号病史相关与原始记录病史相关与原始记录其他关键词其他关键词提供其他关键词的机构提供其他关键词的机构数据提供者机构数据提供者机构文章总页数文章总页数出版商提供数据时间出版商提供数据时间期刊出版
16、国期刊出版国数据库文献编号数据库文献编号2023/2/2复旦大学图书馆文献检索教研室22作为主题词的个人姓名作为主题词的个人姓名出版状态出版状态文献类型文献类型出版模式(纸张或电子)出版模式(纸张或电子)参考文献数参考文献数已撤回的文献已撤回的文献酶或化学物质代码酶或化学物质代码正在撤消中的文章正在撤消中的文章初版文献初版文献修订和再版的文章修订和再版的文章子专题文档子专题文档太空署提供的数据太空署提供的数据二次文献数据库以及文章讨论的二次文献数据库以及文章讨论的分子序列访问号分子序列访问号原文来源原文来源引用了病例的文献内部处理代码引用了病例的文献内部处理代码标准期刊缩写标准期刊缩写文献标题
17、文献标题翻译标题翻译标题更新文献更新文献文献正在更新文献正在更新期刊卷号期刊卷号三、三、PubMed PubMed 基本检索规则基本检索规则截词检索:截词检索:treat*treat*可检出:可检出:treat,treated,treatment.treat,treated,treatment.强迫短语检索:强迫短语检索:“”,不进行自动转换匹配和扩展,不进行自动转换匹配和扩展检索检索如:如:“acute low back painacute low back pain”“ang 1ang 1”(血管紧张素(血管紧张素1 1缩写)检出缩写)检出10851085篇篇比较:比较:ang 1 ang
18、 1 检出检出99569956篇,误检多,其中有:篇,误检多,其中有:2023/2/2复旦大学图书馆文献检索教研室232023/2/2复旦大学图书馆文献检索教研室24三、三、PubMed PubMed 基本检索规则基本检索规则自动转换匹配检索词:自动转换匹配检索词:对对常常用用医医学学名名词词自自动动在在规规范范词词索索引引(主主题题词词、副副主主题题词词、物物质质名名称称)中中转转换换、并并默默认认在在所所有有记记录录字段中匹配。字段中匹配。如如:liver liver cancer cancer liver liver neoplasmsneoplasmsMeSH MeSH TermsTe
19、rms OR OR(liverAll(liverAll Fields Fields AND AND neoplasmsAll neoplasmsAll Fields)Fields)OR OR liver liver neoplasmsAll neoplasmsAll Fields Fields OR OR(liverAll(liverAll Fields Fields AND AND cancerAll cancerAll Fields)Fields)OR OR liver cancerliver cancerAll FieldsAll Fields 2023/2/2复旦大学图书馆文献检索教研
20、室252023/2/2复旦大学图书馆文献检索教研室26结果显示页右侧结果显示页右侧Details显示系统自动匹配转换显示系统自动匹配转换的检索词的检索词2023/2/2复旦大学图书馆文献检索教研室27四、PubMed 检索限制PubMed可以针对检索结果作进一步的限制Article types 文献类型限定 Text availability 全文、免费全文、摘要限定Publication dates 出版日期限定Species 研究对象人/动物限定Languages 语种限定Sex 性别限定Subjects 各主题领域限定Journal categories 各种专题子数据库限定Ages 年
21、龄限定Search fields 字段限定2023/2/2复旦大学图书馆文献检索教研室282023/2/2复旦大学图书馆文献检索教研室29五、PubMed 高级检索一个网页中集多种功能于一体其他检索资源其他检索资源检索历史检索历史检索式编制检索式编制检索词索引检索词索引基本检索基本检索2023/2/2复旦大学图书馆文献检索教研室30Search BuilderSearch Builder(检索式编制):(检索式编制):检索框中只能输入检索词,不能输入检索式。检索框中只能输入检索词,不能输入检索式。多个字段检索要分多次输入。多个字段检索要分多次输入。Search HistorySearch Hi
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