基于主成分分析法开展种公牦牛选种工作-李超.pdf
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1、畜牧与兽医2017年第49卷第12期 19李超,朱勇,次旦央吉,等基于主成分分析法开展种公牦牛选种工作J畜牧与兽医,2017,49(12):19-23Li C,Zhu Y,Cidanyan自i,et a1Selecting of Yak Bulls precisely by principal components analysisJAnimal HusbandryVeterinary Medicine,2017,49(12):19-23基于主成分分析法开展种公牦牛选种工作李超,朱勇,次旦央吉,张强,张成福,洛桑,平措占堆,曹涵文,姬秋梅,达娃央拉,信金伟4(西藏自治区农牧科学院畜牧兽医研究所
2、,西藏拉萨850000)摘要:本文基于主成分分析法筛选种公牦牛,提高对样本个体筛选的精确性,为后续育种工作提供科学依据。对西藏六个不同地方的牦牛群体展开了体尺体重测量,对不同群体进行了方差分析,隶属于桑日县的牦牛群体较其他群体在体尺体重上较优秀(P001):其后,对76个样本进行了主成分分析,将体高(x)、体斜长(X2)、胸围(X 3)、管围(x4)和体重(x,)降维,由新变量体格因子z,和运动因子z:对整个数据样本解释,并对样本进行预测,筛选出体格因子较优的36号、37号和38号样本,以及运动因子较优的4号和58号样本。关键词:主成分分析;种公牛;体尺;体重中图分类号:$81325 文献标志
3、码:A 文章编号:05295130(2017)12一001905Selecting of Yak Bulls precisely by principal components analysisLI Chao,ZHU Yong,Cidanyangji,ZHANG Qiang,ZHANG Chenfu,Luosang,Pingcuozhandui,CAO Hanwen,JI Qiumei,Dawayangla,XIN Jinwei+(Institute of Animal Science and Veterinary Medicine,TAAAS,Lhasa 850000,China)Abstr
4、act:The present study was conducted to improve selection of Yak Bull breeding by using principal components analysisYak groupsfrom six different districts in Tibet were measured in body weight and body sizeThe yak group in Sangri County is better than the othergroups in the weight and body size(P001
5、)Dimensions were reduced from height(X1),body length(X2),bust(X3),tube circumference(X4)and weight(X5)to physique character(Z 1)and sport character(Z2)with the method principal components analysisThe36th,37th and 38th samples were better than the others in physique character and the 4th and 58th sam
6、ples were better than the others insport characterkey words:principal components analysis;yak bulls;bodysize;body weight现代化的牦牛产业逐步发展,对牦牛选育工作的要求也越来越强,开展牦牛品种间选育研究,有利于改善因选育不当而造成的品种衰退和品种灭亡。目前,牦牛等家畜育种主要集中在以遗传资源为主导的分子育种上。牦牛育种工作,从理论上讲,只要根据牦牛个体所有性状的基因和基因型的组织结构及功能效应进行整体或全基因组选择、选配、保种、杂种优势分析利用等,就可能取得最大的效果一1I。但
7、因研究技术、操作程序较复杂此类技术应用于基层育种收稿日期:20161202;修回日期:20170920基金项目:西藏自治区自然科学基金(2016zr一1549):西藏自治区重大科技专项(Z2016801 N04)作者简介:李超(1986-),男,助理研究员,硕士,研究方向:草地资源利用,E-mail:1icha0866560hot mailcon工作相对较少:在牧区选育工作中。还是以传统的选育方式为主,其中选取较优秀的、价值高的种公牦牛是选育工作中的重要一环。在种公牛的选择上,有人运用统计知识开展了种公牛的选择,但只涉及某一指标,不能从整体上推测并选出潜力最大的种公牛。2-3。目前国内外研究比
8、较多的遗传参数为体尺体重【4-5。研究表明这些参数会影响牲畜的其他生产性能。6。7,也有利于规划育种方案。8一。,说明这些指标在育种过程中的重要性,且遗传力很高,有很强的相关性1。本文拟将这些遗传参数作为统计指标,定位性状表型较优的个体,对指导种公牛进一步选育提供重要的参考依据。1材料与方法+通信作者:信金伟(1981一),男,副研究员,硕士,研究方 11牦牛体尺体重测定背景与地点向:牦牛遗传育种,E-mail:734821212qqc。m 于2013年1011月期间,对昂f_县、亚东县、万方数据20 Animal HusbandryVeterinary Medicine 2017 V0149
9、 No12桑日县、错那县、隆子县、申扎县等西藏6个地方的牦牛进行了体尺体重测定。12测定工具、项目指标和方法测定工具:测杖、卷尺、地秤产Weigh Scale w210);主成分分析原理见SPSS多元统计分析方法及应用11。(型号:新西兰 2 结果与讨论测定项目:根据畜禽遗传资源调查技术手册规定的体尺体重测定方法,分别测定了牦牛的体高(X。)、体斜长(X:)、胸丽(X,)、管围(X。)和体重(X,);空腹测量随机取样,现场进行测定。13数据统计分析记录所有的测定数据,用Excel初步处理后,用统计软件R330进行了方差分析和主成分分析,其中差异显著时采用HSD检验法对各组问平均数进行多重比较,
10、结果表示为平均值标准误(或标准差),21体尺体重分析从表l可以得出,在体高、体斜长、胸围和管围上表现较优的为桑日县和昂仁县的样本,较差的为申扎县的样本(P001);在体重上,桑日县的样本较优,申扎县和错那县的较差(P001)。整体表现较优的为隶属于桑日县的公牦牛群体,在各项指标上都优于其他群体样本,其次是隶属于亚东县的公牦牛:表现较差的集中在申扎县和错那县,隆子县的群体样本也在管围、体重等指标上表现较差,但错那县的样本在体斜长上表现较好。表1 6个牦牛群体方差分析注:同列数据比较,肩标大写字母表示差异极显著(P001);数字后小写字母表示差异显著(P005)22对6个群体76个样本做主成分分析
11、221 筛选主成分由表2可以得出,由于前两个主成分的积累贡献率已达到95另外三个主成分可以舍去,达到将维的目的,即将原始指标变量体高(X)、体斜长(x:)、胸围(X,)、管围(X。)和体重(x,)转变成新的矩阵,由z,和Z,对整个数据样本进行解释,即下面主成分分析结果。主成分分析结果:Z1=0455X1+0443X2+0458X3+0413X4+O465X5Z,=一0137X一0389X,一0166X3+0888X4012X5第1主成分对应系数的符号都相同,其值在045左右即Z=0455体高+0443体斜长+0458x胸围+0413管围+0465体重。它反映了公牦牛体重体尺等魁梧程度:身材较魁
12、梧的牦牛,其5项指标都比较大,因此,第1主成分的值就较大(因为系数均为正值);而身材较瘦小的牦牛,其5项指标皆较小,因此,第1主成分绝对值就较小,可以将第1主成分定义为体格因子。第2主成分,即Z,=一0137体高一0389体斜长一0166x胸围+0888管围一012x体重。管围占的比例最大,且符号为正其他几项为负,影响第2主成分的值,其中体斜长值最大;第2主成分值较大的表明该牦牛攀爬适应环境能力越强,而第2主成分值越小的表明其攀爬适应环境能力较弱。因此,称第2主成分为运动因子。222对样本做预测从图1可以看出:体格高大型和运动能力较强的牦牛个体大致所在的样本区域(箭头所指区域);再通过查阅表3
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- 基于 成分 分析 开展 牦牛 选种 工作
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