生化复习题提纲1.doc
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1、Four short words sum up what has lifted most successful individuals above the crowd: a little bit more.-author-date生化复习题提纲1生化复习题提纲1基础生化复习思考题第一章: 蛋白质化学 1举例说明蛋白质在生命活动中的重要作用。如何计算生物材料中的蛋白质含量,根据是什么。2由DNA直接编码的二十种氨基酸作为蛋白质的基本构成单位,它们在化学结构上有那些特点。3氨基酸的基本化学反应。氨基酸和蛋白质的两性解离及等电点。如何计算氨基酸的等电点。茚三酮反应(ninhydrin reactio
2、n) : -氨基酸及具有游离-氨基的肽都产生紫色化合物,而脯氨酸和羟脯氨酸产生黄色的产物。4蛋白质化学结构和空间结构的概念 ,层次。阐明-螺旋,-折叠,-转角的要点,维持三级结构的作用力(主要是次级键或非共价键(氢键、离子键(盐键)、疏水键和范德华引力),共价键(肽键和二硫键)。简述胰岛素的一级结构,肌红蛋白三级结构,血红蛋白四级结构。亚基,寡聚蛋白的概念。蛋白质的C-末端和N-末端。-螺旋要点:1. 在螺旋体中,3.6个氨基酸残基旋转一周,每个氨基酸残基上升间距0.15nm,螺距0.54nm(0.153.6=0.54)。2. 链中R基团分布在螺旋外侧。3. 其稳定性靠链内氢键联系。.5蛋白质
3、的胶体性质及其实用意义,蛋白质的变性和沉淀,变性和沉淀主要区别是什么? 有何实用价值?蛋白质沉淀:蛋白质分子由于脱水、失去电荷、变性或生成难溶盐,而从溶液中沉淀析出。 蛋白变性:在理化因素的影响下,天然蛋白质分子内部原有的高级结构发生变化时,其理化性质和生物学功能都随之改变或丧失,但并未导致一级结构的变化。6那些因素可以使蛋白质沉淀,其原理是什么?那些因素可以使蛋白质变性,变性的蛋白质性质有那些显著变化?蛋白质变性后,某些特性会发生改变:(1)生物活性丧失(构象改变);(2)溶解度降低、粘度增大、扩散系数变小等;(3)疏水基团外露,导致光学性质变化;(4)对蛋白酶降解的敏感性增大。 7名词解释
4、:肽键;肽平面;次级键;必需氨基酸;氨基酸残基;盐溶和盐析;透析电泳,蛋白质变性和复性。第二章:酶学1酶的概念,酶的组成。酶的系统和习惯命名与分类。酶在生物体内的重要作用。酶作为生物催化剂与一般无机催化剂有那些共性与特性,酶的专一性。2.酶的活性中心,中间产物学说,诱导契合学说主要观点。3影响酶促反应速度的主要因素与机理。米氏方程的数学表达式,Km值的定义,测定Km的意义。4酶的最适温度,最适PH,酶的激活剂,酶的抑制剂及抑制类型,抑制机理。5同工酶概念,生物学意义。变构酶的特点,调节机理,动力学特征。共价调节酶,诱导酶的概念。别构酶的特点:1.一般由两个或以上的亚基组成(寡聚酶),除有活性部
5、位外,还有与调节物结合的调节部位(变构部位)。2具有别构效应:当底物或效应物和酶分子上的相应部位结合后,会引起E分子构象的改变,从而影响E的催化活性。3不符合米氏曲线,多数为S型。4别构酶分子中一个活性部位能影响同一分子的另一个活性部位。6酶促反应的初速度,酶的活力,酶的活力单位,酶的比活力(单位质量样品中的酶活力。),酶的转换数。7什么是单体酶,寡聚酶,多酶体系。8维生素的概念,几种主要水溶性维生素与辅酶和辅基的关系,功能基团是什么?各自参与体内的那类代谢反应。TPP,FMN,FAD,CoA,ACP,NAD,NADP,DHF THF(FH4)的中文名称。第三章 核酸化学1核酸种类与分布,DN
6、A和RNA在化学组成上的异同点。核苷,核苷酸的概念。NMP,NDP,NTP,dNMP,dNDP,dNTP,cAMP,cGMP的中文名称。2Chargaff定则的主要内容,它在确立DNA双螺旋模型中的作用。3双螺旋模型的要点。维持双螺旋结构稳定的力,双螺旋模型的主要贡献。(1)DNA分子由两条反向平行的多核苷酸链构成双螺旋结构。两条链围绕同一个“中心轴”形成右手螺旋,螺旋表面有一条大沟和一条小沟。(2)嘌呤碱和嘧啶碱层叠于螺旋内侧,碱基平面与纵轴垂直,碱基之间的堆集距离为0.34nm。磷酸与脱氧核糖在外侧,彼此之间通过磷酸二酯键连接,形成DNA的骨架。糖环平面与中轴平行。(3)双螺旋的直径为2n
7、m,顺轴方向每隔0.34nm有一个核苷酸,两个核苷酸之间的夹角为36,因此,沿中心轴每转一周有10个核苷酸。(4)一条多核苷酸链上的嘌呤碱基与另一条链上的嘧啶碱基以氢键相连,匹配成对,配对的原则是A=T之间形成二个氢键,G三C之间形成三个氢键。因此DNA的两条链互补。4tRNA的共同特征,二级结构,三级结构。5真核细胞和原核细胞mRNA结构的区别。帽子结构,polyA结构。6DNA,RNA的溶解特性,粘度特征,沉降特征。两者在酸,碱条件下水解特性的区别和原因。增色效应和减色效应的概念,机理。Tm含义,Tm与那些因素有关。7核酸变性和复性的概念及用途第四章: 碳水化合物代谢1什么是糖核苷酸,糖核
8、苷酸在糖代谢中有那些重要作用?在生物体内第一个发现的糖核苷酸是那一种?2生物体内蔗糖生物合成有那几条酶促反应途径?其中最主要的途径是那条?1.蔗糖合成酶2磷酸蔗糖合成酶(主要途径)3蔗糖水解有那些酶促反应途径?1蔗糖酶(转化酶):催化蔗糖水解成G和F。(不可逆)2蔗糖合成酶:催化蔗糖与UDP反应生成果糖和尿苷二磷酸葡萄糖。4试述直链淀粉和支链淀粉生物合成的酶促反应途径。5简述淀粉降解(水解、磷酸解)的酶促反应途径。6糖酵解定义,酶促反应途径,3个不可逆反应,氧化反应,磷酸化反应,反应的能量计算,调控机理,生理意义。7简述丙酮酸的去向。8简述乙醛酸循环的生化历程及生理意义。9葡萄糖异生的酶促反应
9、途径。植物葡萄糖异生的特点。10丙酮酸脱氢酶复合体的组分,从丙酮酸到乙酰辅酶A的酶促反应途径,及调控机理。11三羧酸循环的酶促反应途径,氧化反应,磷酸化反应,脱羧反应,调控机理,生理意义,回补反应,能量计算。12磷酸戊糖途径的主要特点,氧化阶段酶促反应的途径与产物,非氧化阶段的主要产物,生理意义。第五章:生物氧化与氧化磷酸化1生物氧化的概念、特点。2高能键的含义,高能磷酸化合物的概念,类型,三磷酸腺苷(ATP)的结构,特殊作用。3电子传递链的定义,传递载体,电子传递复合体的名称,组份,作用及排列顺序。电子传递链的抑制剂及抑制部位。4氧化磷酸化和底物水平磷酸化的概念,ATP合成酶的组份、作用,P
10、/O比值的概念,解偶联作用。底物水平磷酸化:底物氧化过程中,高能代谢中间产物,通过E促磷酸基团转移反应,直接偶联ATP的形成。电子传递偶联的磷酸化 (氧化磷酸化):当电子从NADH或FADH2经过电子传递体传递到O2形成H2O时,同时偶联ADP磷酸化为ATP,这一过程称电子传递偶联的磷酸化。5试述化学渗透学说的机理。(1)递H体与递电子体交替排列,定位于线粒体内膜。(2)递H体有H泵作用,将2H+泵出内膜,2e传给递电子体,整个过程泵出3对H+造成H+跨膜梯度(3)线粒体膜对H+不通透,造成H+跨膜梯度。(4)H+通过线粒体F1F0ATP酶进入内膜,释放出的自由能推动ATP合成。6糖酵解生成的
11、NADH2如何进入到线粒体进行氧化磷酸化。生物氧化和氧化磷酸化主要在线粒体内进行,而NAD+和NADH不能自由地透过线粒体内膜,因此在胞液内生成的NADH(如糖酵解途径产生的NADH)必须通过特殊的穿梭机制进入线粒体。已知动物Cell有两个穿梭系统:(1)甘油-3-磷酸穿梭系统(肌Cell);(2)苹果酸穿梭系统(肝Cell)。第六章脂代谢1-磷酸甘油合成的酶促反应途径。1、EMP中的DHAP还原2、甘油在甘油激E的催化下生成磷酸甘油2大肠杆菌乙酰辅酶A羧化酶复合体的组份及其催化的生物化学反应及反应产物,BCCP的名称及作用。乙酰COA羧化酶复合体由生物素羧化E(BC)、羧基转移E(CT)、
12、生物素羧基载体蛋白(BCCP)三个不同的亚基组成,其中BCCP连结有生物素辅基。每个亚基行使着不同的功能,但只有当他们聚合成完整的酶后才有活性。3大肠杆菌脂肪酸合成酶复合体的组份及所催化的生化反应的历程,ACP的名称及作用。脂肪酸合酶系统是一个多酶复合体,7种蛋白组成,6种酶以酰基载体蛋白为中心。酰基载体蛋白(ACP)六种酶1.乙酰COA:ACP酰基转移酶(AT);2.丙二酸单酰COA:ACP转移酶(MT);3.酮脂酰-ACP合成酶(KS);4.酮脂酰-ACP还原酶(KR);5.羟脂酰-ACP脱水酶(HD);6.烯脂酰-ACP还原酶(ER)反应历程:(1)第一阶段:乙酰基和丙二酸单酰基进位。乙
13、酰基进位:乙酰COA在转移酶催化下,乙酰基被转移到中央巯基上。乙酰基移位:乙酰基由中央巯基转移到外围巯基上。丙二酸单酰基进位:丙二酸单酰COA在转移酶催化下,丙二酸单酰基被转移到中央巯基上。(2)第二阶段:脂肪酸链延伸缩合:在合成酶催化下外围巯基上的乙酰基与中央巯基上的丙二酸单酰基缩合成酮丁酰基连接在中央巯基上,同时释放出一分子CO2。还原:在还原酶催化下,酮丁酰基位羰基被NADPH还原成羟基,生成羟酯酰基。脱水:在脱水酶催化下羟丁酰基的、碳原子间脱水生成反市式烯丁酰基。还原:在还原酶催化下烯丁酰基的、之间双键被NADPH还原成单键,生成延长了两个碳单位的丁酰基。生成的丁酰基再与新进位的丙二酸
14、单酰基重复上述缩合、还原、脱水、再还原的循环反应,又延长两个碳片段。生成己酯酰基,如此反复进行,直至生成软酯酰基为止。软脂酰-ACP是硫酯酶的底物,该酶催化生成软脂酸和HS-ACP。这就是第三阶段的反应。(3)第三阶段:脂酰基水解 当中央巯基上的脂酰基延长到一定程度(不超过16碳)后,在硫酯酶的作用下,ACP上的脂酰基或被转移到COA上,或形成游离脂肪酸,或者直接用于合成磷脂酸。4大肠杆菌-酮酯酰ACP合成酶的催化特点。大肠杆菌脂肪酸从头合成途径与碳链加长途径有何区别。酮脂酰-ACP合成酶(KS)多肽链半胱氨酸残基上的巯基叫外围巯基。5简单概括脂肪酸合成的生化历程。6简述脂肪合成的酶促反应历程
15、。7何谓脂肪酸的-氧化,简述-氧化的生化历程。8在胞浆的长链脂肪酸是如何进入线粒体的?1.脂肪酸在细胞质中活化为脂酰CoA;2.脂酰CoA通过转运系统(肉毒碱穿梭系统)进入线粒体基质脂肪酸从头合成和与分解的异同从头合成b-氧化酰基载体ACPHSCoA反应历程缩合还原脱水还原脱氢加水脱氢硫解参与因子NADPHFAD 、 NAD+酶7种4种底物转运柠檬酸穿梭系统肉碱转运细胞定位胞液线粒体基质共同中间产物酮脂酰基、羟脂酰基、烯脂酰基第七章:含氮化合物代谢1氨的同化包括那些内容?高等植物氨同化的主要途径是什么?生物体内有两种方式同化氨。合成方式有两种:1、酮酸氨基化。2、转氨基作用1.谷氨酸合成途径
16、所有生物都通过谷氨酰胺合成酶和谷氨酸脱氢酶催化形成谷氨酸和谷氨酰胺的方式同化氨。(1) 谷氨酰胺合成酶和谷氨酸合酶催化合成,现有试验证明,谷氨酸的合成,主要通过这条双酶途径催化的。(2) 非主要途径 谷氨酸脱氢酶途径2.氨甲酰磷酸的形成2转氨基作用的概念。转氨酶的辅酶是什么?转氨酶在氨基酸代谢重的重要作用。AA和酮酸之间氨基的转移作用,是氨基酸脱去氨基的一种重要形式。辅酶均为磷酸吡哆醛(B6的磷醛酯)。3氨基酸降解有那些基本途径。氧化脱氨、非氧化脱氨、联合脱氨的基本内容、重要的酶及辅酶。4几种重要的脱羧反应及脱羧产物、脱羧酶的辅酶。1.直接脱羧基作用氨基酸在脱羧酶作用下,进行脱羧反应生成胺类化
17、合物,脱羧酶辅酶为磷酸吡哆醛。广泛存在于动、植、微生物中。(羧化酶的辅基为生物素)2.羟化脱羧基作用 Tyr在Tyr酶催化下发生羟化作用生成3,4二羟苯丙氨酸(多巴),后者进一步脱羧生成3,4二羟苯乙胺(多巴胺)。多巴进一步氧化后形成聚合物黑素。5简述动物的排氨类型。在哺乳动物体内,氨的主要去路是在肝脏中合成尿素并随尿排出体外。氨基酸分解产物NH3的去路:1.重新形成氨基酸;2.形成酰胺(消除NH3毒害,贮存NH3);3.生成铵盐,保持细胞pH;4.生成尿素的和鸟氨酸循环。在哺乳动物体内,氨的主要去路是在肝脏中合成尿素并随尿排出体外。在部分植物体内尿素的形成既能解除氨毒,又是氨的一种贮存形式。
18、6生糖氨基酸、生酮氨基酸的概念。在体内可转变成糖的AA称为生糖AA。在体内能转变为酮体的AA称为生酮氨基酸。7嘌呤核苷酸合成代谢中生成的第一个嘌呤核苷酸是什么?简述嘌呤核苷酸各元素的来源。各种嘌呤类核苷酸的前体是次黄嘌呤核苷酸(IMP,或称之肌苷酸)。N-1来自天冬氨酸;C-2和C-8来自甲酸(通过10-甲酰四氢叶酸);N-3和N-9来自谷氨酰胺的酰胺基;C-4、C-5和N-7都来自甘氨酸;C-6来自CO2。8嘧啶核苷酸合成途径中生成的第一个嘧啶核苷酸是什么?各种嘧啶核苷酸的前体是尿嘧啶核苷酸(UMP)。C-2来自HCO3;N-3来自谷氨酰胺的酰胺基团;其余原子都来自天冬氨酸。9催化蛋白质及核
19、酸降解的酶主要有那些?蛋白酶(肽链内切酶),水解肽链内部的肽键。胃蛋白酶、胰蛋白酶、胰凝蛋白酶、枯草杆菌蛋白酶、弹性蛋白酶、木瓜蛋白酶、菠萝蛋白酶。肽酶(肽链外切酶):分别从多肽链游离的羧基端或游离的氨基端逐一地将肽链水解成氨基酸(羧肽酶或氨肽酶)。第八章 核酸的生物合成1中心法则的内容、半保留复制的概念、证据。2DNA生物合成中有那些酶和蛋白质因子参与,简述这些成员的功能。模板、四种dNTP、底物、Mg2+外,在起始、延长、终止各阶段都需酶及蛋白因子。DNA聚合酶I(单体酶:单肽链) 主要功能:负责DNA的损伤修复及在DNA复制中,切除引物,填补空隙的作用。主要负责DNA的损伤修复。 若用枯
20、草杆菌蛋白酶处理此酶,可得两个片段: a.分子量76KD,有53聚合酶和35外切酶活力,叫Klenow片段。3 5外切活性能及时切除错配核苷酸(发生错配时,此E活性提高),与53聚合活性共同保证DNA复制的过程中的高保真度。广泛用于DNA序列分析和其它研究。 b.分子量34kD,53外切酶活力。作用于双链DNA的碱基配对部分,从5端切下单核苷酸或寡核苷酸。在DNA损伤修复和切除RNA引物中发挥作用。DNA聚合酶(单体酶) 主要功能参于DNA的损伤修复 具有53聚合活力,较弱,35外切活性。但无53外切活性。 DNA聚合酶 (寡聚酶)是催化大肠杆菌DNA复制的主酶DNA聚合酶 IV和V 与DNA
21、的修复有关。 2、引物酶和引发体引物酶合成一小段RNA引物(有游离的3OH),作为DNA合成的引物。引物酶为一条单链多肽,单独存在时相当不活泼,只有与几 种辅助蛋白组装成引发体,才有合成引物活性。3、DNA连接酶催化双链DNA中一条链上缺口的共价连接,形成3,5磷酸二酯键。4、DNA解螺旋酶DNA双螺旋在复制和修复中都必须解链,以便提供单链DNA模板。5、单链DNA结合蛋白SSB结合蛋白的作用:DNA双螺旋经解螺旋酶解链形成的单链很快被SSB所覆盖。保护单链DNA免遭核酸的降解,使单链DNA保持伸展态,以便作为模板。降低DNA的Tm,促进DNA解链。原核细胞SSB有协同效应,真核细胞无。协同效
22、应:先结合到已存在的单链区,其后的SSB的结合能力可提高103倍,表现出协同效应。6、拓扑异构E拓扑异构酶,松解螺旋,能切开一条DNA链在复制叉前面的一段DNA的一个磷酸二酯键,允许该DNA链绕着另一条完整的DNA链自由旋转,而后由拓扑异构酶重新形成磷酸二酯键。(不需ATP,可切无DNA双螺旋中的一条链)拓扑异构酶(旋转E)细菌环形DNA复制后,两个DNA分子是互锁的。该酶结合到一双链DNA环上,造成一暂时性的双链断裂,另一DNA 环正好从这一断裂处穿过,然后拓扑异构酶重新封上这个链的断口。(引入负超螺旋,需ATP,消除复制叉前进时产生的扭曲张力。在无ATP时,可松解负超螺旋。可同时切断DNA
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