药物蛋白质组学讲稿.ppt
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1、关于药物蛋白质组学第一页,讲稿共四十页哦第二篇第二篇 药学分子生物学应用药学分子生物学应用一、转录组与转录组学一、转录组与转录组学二、转录组学在药学中的应用二、转录组学在药学中的应用第八章第八章 药物转录组学药物转录组学(pharmacotranscriptomics)第二页,讲稿共四十页哦转录组(转录组(transcriptome)广义:指在某一生理条件下、一种细胞、组织、器官广义:指在某一生理条件下、一种细胞、组织、器官或生物体所能转录出来的或生物体所能转录出来的所有所有RNA的的总和,包括总和,包括mRNA和非编码和非编码RNA。狭义:指所有狭义:指所有mRNA的集合。的集合。转录组学(
2、转录组学(transcriptomics)在整体水平研究细胞中基因转录情况及其调控规在整体水平研究细胞中基因转录情况及其调控规律的学科。律的学科。研究方法:研究方法:基因芯片技术、基因芯片技术、SAGE(基因表达系列分析)、基因表达系列分析)、MPSS(大规模平行信号测序系统)、(大规模平行信号测序系统)、RNA测序测序第三页,讲稿共四十页哦一、药靶候选基因的鉴定一、药靶候选基因的鉴定第二节第二节 转录组学在药学中的应用转录组学在药学中的应用二、反义药物和二、反义药物和siRNA药物药物包括:反义包括:反义DNA、反义反义RNA、核酶核酶 反反义义药药物物:通通过过与与靶靶DNA 或或 mRN
3、A 互互补补杂杂交交,阻阻止止或或抑抑制制靶靶基基因因表表达达,发发挥挥治治疗疗作作用用的药物。的药物。第四页,讲稿共四十页哦反义药物反义药物特点特点:新的化学物质(新的化学物质(核酸核酸););新的药物受体新的药物受体(DNA或或mRNA););新的结合方式(新的结合方式(碱基配碱基配对对);新的结合后反应();新的结合后反应(降解靶降解靶RNA)。)。第一个反义药物:第一个反义药物:福米韦生福米韦生(fomivirsen)1998年年,美美国国FDA批批准准,由由21个个硫硫代代脱脱氧氧核核苷苷酸酸组组成成。通通过过抑抑制制人人类类巨巨细细胞胞病病毒毒(CMV)mRNA发发挥挥抗抗病病毒毒
4、作用。作用。第五页,讲稿共四十页哦siRNA药物药物 根根据据RNA干干扰扰原原理理设设计计出出来来的的小小干干扰扰RNA,通通过过诱诱导导同同源源mRNA降降解解,有有效效阻阻断断基基因因表表达达,起起到到治治疗疾病效果。疗疾病效果。VEGF可可促促进进湿湿性性老老年年性性黄黄斑斑变变性性(wet-AMD)眼眼中中新新血血管管的的生生长长,使使血血液液渗渗漏漏进进人人眼眼内内,从从而而导导致致视力丧失。视力丧失。OPKO公公司司开开发发出出Bevasiranib(siRNA药药物物),抑抑制制VEGF表达表达,治疗治疗AMD。基因失活性治疗基因失活性治疗第六页,讲稿共四十页哦第二篇 药学分子
5、生物学应用 第九章第九章 药物蛋白质组学药物蛋白质组学(Phamacoproteomics)一、概述(概念、分类、主要技术)一、概述(概念、分类、主要技术)二、药物蛋白质组学及应用二、药物蛋白质组学及应用第七页,讲稿共四十页哦一、蛋白质组学一、蛋白质组学(proteomics)蛋白质蛋白质组组(Proteome):一种细胞、某一特定组一种细胞、某一特定组织或个体所表达的织或个体所表达的全部蛋白质。全部蛋白质。蛋白质组学蛋白质组学(Proteomics):从从整体水平研究蛋白质整体水平研究蛋白质组成、表组成、表达水平、翻译后修饰、相互作达水平、翻译后修饰、相互作用的学科。用的学科。第八页,讲稿共
6、四十页哦第九页,讲稿共四十页哦二、蛋白质组学分类二、蛋白质组学分类 1.表达蛋白质组学:表达蛋白质组学:比较比较正常样品正常样品与与病理病理样品样品、药物治疗、药物治疗前前后后样品的蛋白质表达或样品的蛋白质表达或修饰差异。修饰差异。2.结构蛋白质组学:结构蛋白质组学:分析蛋白质或复合分析蛋白质或复合体结构、定位体结构、定位3.功能蛋白质组学:功能蛋白质组学:研究蛋白质功能研究蛋白质功能第十页,讲稿共四十页哦基因组基因组-转录组转录组-蛋白质组蛋白质组DNA(Genome)RNA(Transcriptome)Proteins(Proteome)DNA sequencingWhole genome
7、Microarray2D-PAGEMS/MS?第十一页,讲稿共四十页哦四、蛋白质组学主要研究技术四、蛋白质组学主要研究技术1、蛋白质分离、蛋白质分离双向凝胶电泳技术双向凝胶电泳技术2、蛋白质鉴定、蛋白质鉴定生物质谱生物质谱3、蛋白质、蛋白质-蛋白质相互作用蛋白质相互作用蛋白质芯片、酵母双杂交蛋白质芯片、酵母双杂交第十二页,讲稿共四十页哦双向凝胶电泳技术双向凝胶电泳技术第十三页,讲稿共四十页哦双向凝胶电泳技术双向凝胶电泳技术第十四页,讲稿共四十页哦双向凝胶电泳技术双向凝胶电泳技术第十五页,讲稿共四十页哦Sample (a)Sample(b)Sample(c)Present in(a)and(c)
8、not(b)Present only in(a)Stronger in(b)than(a)or(c)双向凝胶电泳图像分析双向凝胶电泳图像分析第十六页,讲稿共四十页哦荧光差异显示双向电泳荧光差异显示双向电泳 (2D-DIGE)第十七页,讲稿共四十页哦关关 键键 问问 题:题:如何鉴定双向电泳分离出来的蛋白质?如何鉴定双向电泳分离出来的蛋白质?第十八页,讲稿共四十页哦质质 谱谱 分分 析析质质谱谱:是是将将被被测测物物用用一一定定的的方方法法离离子子化化,然然后后按按产产生生的的带带电电离离子子的的质质荷荷比比(质质量量/电电荷荷,m/z)进进行行分分离离并并检检测测,最最后后根根据据各各离离子子
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