启航西医综合生化笔记.docx
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1、西医综合笔记生 物 化 学结构 理化性质功能Chapter 1 蛋白质一、分子组成:1、特别元素N: 每g氮=6.25g蛋白质基本组成单位:aaNH2氨基酸:R-C-COOH H 带-OH的aa:丝、苏、酪、(化学修饰)含疏基的aa:半胱氨酸(酶的活性中心、有保护作用)(谷胱期太)酸性aa:天冬氨酸、谷氨酸(带负电荷)碱性aa:精、赖、组 (解离带正电荷)二、aa的理化性质:两性解离:aa的等电点(PI) PHPI,解离为阳离子PH=PI,成为兼性离子,是电中性PHPI,解离为阴离子举例PI1=4.0 PI2=7.8的两种氨基的电泳分离时,分离液PH值介于两个之间茚三酮反应570nm紫外吸收2
2、80nm三、aa的生理功能:多肽链、蛋白质的主键是肽键,其余为次级键多肽链有方向性,由N端C端(-氨基,-羧基)例:小肽 NH2-精一天冬-甘-谷-COOH 室全不同的肽链NH2-谷-甘-天冬-精-COOH肽键平面:四、蛋白质的分子结构1、一级结构aa的组成及排列顺序,最重要的结构,基因序例由遗传信息决定一级结构2、二级结构:一级结构折叠盘旋、表现为-螺旋,-折叠-转角 无规卷曲、除肽键以外的次级键:氢键。3、三级结构:特点为(1)形状呈现椭圆形、球形(2)空间维持的次级键主要为疏水键、离子键、氢键、范得华力也参及(3)使疏水集团位于内部,亲力集团位于外部,使稳定存在于水中,折叠盘旋后形成数个
3、结构域4、四级结构:两个(或以上)是有三级结构的多肽链组成的结构,即不同的蛋白质的亚基,不是在三级结构的基础上盘旋而形成的对大部分蛋白质来源,具有三级或四级结构才具有生物活性,但并不是所有的有生物活性的蛋白质具有三级(或以上)的结构。五、蛋白质的理化性质:1、 两性触离:兼性、同样有PI2、 紫外线吸收:入=280nm有最大吸收值,测蛋白质含量3、 大分子物质4、 沉淀和变性次级键断裂,主键未断裂:蛋白质从溶液中析出来称为沉淀,Pr在水中的两个稳定因素:水合膜和表面电荷。强电解质(如Nacl)可以抑制弱电触质触离也可以吸收弱电触质的水、使之沉淀,即盐析六、Pr的分离和纯化 1、 利用分子量:分
4、子筛、离心、透析变性后:生物学活性丧失对蛋白酶的敏感性增加,易被水解对化学试剂反应性2、 利用电荷:电泳、层析、变性(denaturatcon)-不涉及-级洁构变性的pr容易沉淀,沉淀的pr不一定是变性的。区别pr变性和沉淀的方法:是沉淀而不是变性盐析法冰工醇(丙酮)-80七、pr的功能和结构的关系分子病- 一级结构发生改变影响其功能,如镰刀形RBCchepter2、核酸一、分类 1、DNA:有基因组DNA,线粒体DNA两种,是遗传信息的携带者2、RNA MRNA:蛋白质合成的模板,指导pr合成tRNA:将AA转运至核蛋白体rRNA:及pr结合在一起,成核蛋白体,为pr合成提供场所二、组成、1
5、、DNA的核酸(dNTP)、A、T、G、C脱氧核糖 磷的一样2、RNA的(NTP) A、U、G、C 核糖特点:主键是一3,5磷的二酯键方向性:由5端3端游离羟基三、DNA(1)DNA一级结构:核苷酸的排列顺序即碱基排列顺序,蕴藏遗传密码。遗传信息就在此处(2)DNA二级结构-双螺旋结构:A=T G=C 碱基无组织器官特异性有种属特异性碱基不受年龄营养状况外在环境影响而改变。例:从大脑取出一段DNA,在上列哪种组织中找出同源系列(可以杂交)人肝猪脑狗肺狼心猪肝 答案为1DNA是反平行的互补双链结构,碱基位于内侧,按A=T,C=G配对存在,直向相反,疏水性堆程力 5-AACGCT-3互补链是3-T
6、TGCGA-5或5-AGCGTT-3(3)DNA的三极结构 双螺旋结构基础上扭曲为超螺旋,并且在pr四、RNA:参及下组成核小体,然后进一步折叠压缩于染色体内,故核小体是染色体基本单位1、mRNA:7甲基鸟甘帽子,5端,尾巴、PolgA、3端(多聚腺苷酸)(转录后又加上去的)2、tRNA:二级结构是三叶草样三级结构是倒L型3、rRNA:及核糖体pr共同组成核糖体DNA和RNA的区别:总体上RNA为单链,DNA为双链RNA中,mRNA最重要,量最少(1%-2%),半衰期最短,tRNA合量介于两者之间,但含稀有碱基最多,rRNA 合量最多五、核酸理化性质1、 在260nm有紫交战吸收峰值2、 高分
7、子物质3、 核酸的变性:DNA:氢键被打断解链温度(Tm):核酸分子内双链解开50%,增色效应/高色效应 Tm值取决于G+C比例,成正此,同时及DNA长度有关DNA变性的复性:解开的单链重新聚合,条件是溶液浓度慢慢降低但在冰浴中是不能复性的,称为退火,减色效应六、杂交的条件及其意义及应用七、核酶:具有酶催化活性的核酸核酸酶能够水解核酸的酶Chapter 3 酶一、酶的化学本质:大部分为pr、少数为RNA、即核酶。单纯酶:仅有aa残基构成的酶综合酶:由酶蛋白和辅助因子组成的酶。辅助因子辅酶:透析、超滤能 辅基 不解除活性中心:及酶的催化性密切相关的空间区或,这些区域的结构称为必需基团。并不是所有
8、的必需集团都在结性中心内。酶原:有活性的酶的前身,酶原激活的过程就是活性中心形成的过程。例:以酶原激活为例说明一级结构中蛋白质同工酶:结构和理化、免疫性质不同、但可催化同一反应的酶、如:乳酸脱氢酶例:丙酮酸 乳酸脱氢酶 乳酸到肝脏 乳酸脱氢酸 丙酮酸糖异生 用工酶 变构酶:通过改变构象而影响酶活性的酶,(变构调节) 调节亚基和催化亚基 别构激活 调节部位和催化部位 别构抑制变物酶常在反应开始表现,为关键酶,限速酶。二、酶的调节方式1、 快调节:(1)通过别构调节(2)化学修饰(最常见的为磷酸化及去磷酸化)(3)不涉及共价键改变(4)涉及到共价键改变(5)常有放大作用2、 慢调节:三、酶的催化反
9、应特点:(1)效率高,能降低反应的活化能(2)特异性高四、酶反应动力学:1、底物浓度,对反应速度的影响:米一曼氏方程VKM反应酶和底物的亲合力,KM定,则亲合力低,反之亦然。(1)当SKM时,V(2)当SKM时,VVma(3)当V1/2Vmax,KmS2、酶浓度:3、温度:最适温度(反应速度最快)4、PH值:最适PH值(反应速度最快)5、激活剂:使酶活性增加6、抑制剂:可逆抑制和不可逆抑制可逆抑制最重要,又分为1竞争性抑制,抑制剂及底物共同竞争酶的性中心,此时常有相似结构,此时KM值增大。Vmax可以不变。 决定VmaxIESES EP2、非竞争性抑制:抑制剂及酶的活性中心以外的部分结合从而抑
10、制酶的活性,KM值不变(有增大,有减小)Vmax减小。IESESI EP3、反竞争性抑制,抑制剂及中间物(ES)结合,KM值下降,Vmax下降,ESESIEP常考点:(1)只有PH,T才有最适条件影响酶促反应。(2)常考抑制剂在不同类型中KM,Vmax的变化Chapter 4 糖代谢分解代谢 最重要合成代谢调节生理意义一、葡萄糖的分解途径:(一)无氧酵解:无氧情况下,产生乳酸,提供少量能量1、关键酶:已糖激酶,6-磷酸果糖激酶,丙酮酸激酶,(1)催化反应都是不可逆反应,单向反应,(2)关键E语性常较低,多为限速E。2、进行的部位:胞液(特别,大部分多在线粒体中进行)3、消耗能量:2ATP 生成
11、能量:4ATP4、重要的中间产物:磷酸二羟丙酮:葡萄糖和甘油的交汇点5、在特殊情况(病理,肺心病,长跑,高原)在特殊的细胞(水质细胞RBC)里起作用。(二)有氧氧化,有氧的情况下,机体ATP主要来源,途径。前阶段相同,丙酮酸在丙酮酸脱氯酶作用下乙酰COA三羧酸循环:(1)有4次脱氢 3次以NAD+NADH3ATP 1次FADFADH22ATP(2)底物水平磷酸化琥珀酸COA琥珀酸:GOPPIGTP底物在分解时将能量传给ADP使ATP琥珀酸COA,1.3一二磷酸甘油酸,磷酸烯醇式丙酮的是高能底物,(3)重要的转变反应(4)三大营养物质转换的枢纽,同时是共同的代谢通路。COA是联结三大营养的物质代
12、谢的枢纽。例:下列哪些物质直接参及三羧酸循环:ABCEF(A)FAD(B)草酰乙酸(C)一酮戊二酸(D)ADP(E)PI(F)GOP(三)磷酸戊糖途径(HMPS)过程不看1、主要作用:(1)不是直接提供能量,而是提供大量NADPH+H为供氢体(2)为核酸的生物合成提供核糖,提供5磷酸核糖2、关键酶:6磷酸葡萄糖脱氢酶3、NADPH的意义:(1)机体最主要的供氢体,为物质还原提供H(2)维持还原型谷胱苷肽(GSH)的含量,利用疏基,还原超氧化物GSHGSHGSSG(氧化型)H20(由GSH还原酶参及)例:“蚕豆病”的原因是体内缺点关键E:6磷酸葡萄脱氢E(3)参及机体生物转化作用NND参及呼吸链
13、,提供ATP,NADPHH不参及例:能为核苷酸酸提供原料,5-磷酸粒糖合成反应,有ATP参及,称合成酶,无ATP参及,称合酶二、糖原合成及分解:保持血糖浓度维持相对稳定的途径(一)1、糖原合成的部位,肝脏和肌肉2、糖原合成的关键E:糖原合酶磷酸化,活性降低;去磷酸化,活性升高3、重有中间物质:UDPG葡萄糖的活化形式,或称为活性葡萄糖4、机体能量合成代谢的主要形式ATP,尚有GTP、CTP、UTP,其中UTP参及糖原的合成其中UTP参及糖原的合成(二)1、糖原分解的关键E:糖原磷酸化酶2、糖原分解的部位, 肝脏(肌肉不能直接分解糖原,因为缺乏)G6磷酸酶,入不能直接补充血糖浓度,肌肉分解糖原指
14、无氧酵解。糖原上一个葡萄糖残基在肌肉分解后产生分子ATP三、糖异生(非糖物质转变为糖):糖无氧分解的逆过程,克服了个能障即1、意义:长期饥饿时,增强补充血糖2、糖异性的四个关键E3、中间产物质都可糖异生产生G大部分:分解:线为体,但G的无氧酵解在胞液进行 合成:胞液Chaper 5 脂代谢类脂:固醇,酯,磷脂及糖酯甘油三酯: 分解 一、甘油三酯的合成及分解(一)分解,甘油三酯 甘油三酯脂肪E(关键E) 甘油脂肪酸该脂肪酶:激素敏感的脂肪酶,易受激素调节,如肾上腺素紧张haper 6生物氧化有关能量的来源途径:()底物水平磷酸化,直接将代谢分子中的能量转移至(),生成(),三步反应;()氧化磷酸
15、化,提供能量更多一、氧化磷酸化:代谢物经氧化分解释放能量,从而偶联ADP磷酸化,产生ATP,电势能-化学能1、呼吸链的排列顺序2、两条呼吸链的组成3、糖耦联磷酸化部位4、P0比值;消耗P和O的比值,即生成ATP摩尔数;NADH:P03 FADH:P025、氯化磷酸化的调节,ADPATP 下降时,ATP多,氯化磷酸化减强二、ATP能量储存,转运的枢纽,GTP、UTP、CTP能量都来自ATP磷酸肌酶可以作为主能化合物,是能量的一种储存形式,但不能直接供能,磷酸肌酸提供磷酸烯醇式丙酮酸:乙酰磷酸,乙酰COADATP DGTP DUTP DCTP不能放能,故不是分解化合物Chephter 7 氨基酸代
16、谢一、一般代谢:指AA的脱氨基作用。少量的脱羧可以生成有活性的物质。1、方式:(1)谷aa脱H酶,(2)转氯基转氨基作用(1)只渗入氨量的转移,不渗及脱落(2)转氨酶的辅E是磷磷吡哆醛(胺)由VitB6转化而来。因此,脱氨基作用多为联合脱氨基,方式有两种,(1)肝、肾、脑中L谷aa氧化脱氨基作用(2)心肌骨骼肌中是嘌呤核苷酸酸循环。2、产物有a酮酸和NH3两种(1)a酮酸的代谢(1)再NH3化,生成相应aa(2)转变为其它物质:糖和酮体,即分为生糖aa,生酮aa,生糖兼生酮aa,包含有例:丙aa(生糖aa)联合脱氨丙酮酸丙酮激ECHCOCOA酮体(理论上可以生成)(3)可以氯化分解供能,可以提
17、供ATPaa可以生成脂肪和糖糖可以部分转化为aa,除外必须aa以食物供给,亮亮颉色,苯蛋赖苏,食物的营养价值取决于必需的种量和数量。 (2)NH3的代谢1、来源(1)aa的脱氨基(主要来源)(2)从肠道而来NH3H+ NM4+OH-吸收入血氨(3)肾小管上皮细胞:谷氨酰胺酶(肝硬化的血氨病人,洗肠时用酸性物质)2、运输:(1)谷氨酰胺的形式:谷aMH3谷氨酰胺肾 、矸脏 (2)葡萄糖丙aa循环 NH3丙酮酸丙氨酸MH3+丙酮酸3、尿素合成鸟氨酸循环(1)部位:肝脏线粒体(2)2个N:1个N来源于NH3,另一个N来源于天冬氨酸(3)3个产物:瓜aa鸟aa不是组成pr的aa二、个别aa代谢,(一)
18、脱羧作用:谷aa CO2一氨基丁酸 色(二)一碳单位:1、概念:某些aa在分解代谢中可以产生含有一个碳原子的基因,2、CO2不是一碳单位,碳单位载体是四氢叶酸3、一碳单位的来源:丝色组甘(施舍一根竹竿)参加四清运动4、一碳单位可以相互转变5、作用:嘌吟,嘧啶的合成原料,故一碳单位是氨基酸和核酸代谢联系的枢纽。三大物质代谢的枢纽是:CH3COTCOA,G6P是糖代谢合成,分解,磷酸糖途径,糖异生不同转化方式的联系枢纽。(三)含硫aa的代谢1、半胱aaPAPS:机体内SO42-的供体2、蛋aa在腺苷转移作用E下SAM(S-腺苷蛋AA) 活性甲基的供体(四)芳香族aa苯丙氨酸缺乏引起苯酮的尿症Cha
19、pter 8 核苷酸代谢 合成为重点1、不是营养物质,无营养核酸之说,不要看过程,记住重要的点一、分类 从头 合成嘧啶核酸 补救 分解 核糖粒甘酸核甘酸 脱氯糖甘酸(一) AMP(GMP)DAMP,ADPDADP, ATPDATP从核糖甘的转变为脱氯核甘的是在二磷的水平上进行的,抗代谢物是谁的类似物?它们抗代谢的生化机制是什么?嘌吟核苷酸代谢的分解产物是尿酸(沉淀在关节,它一沉淀积便提供损伤关节引起痛症,治疗药物为别嘌吟醇,它能抑制黄嘌吟氧化酶的活性从而使尿酸生成减少)。(二)嘧啶核甘酸的代谢产物:-丙氨酸,由胞嘧啶分解生成的。(抗代谢物易出大题,抗代谢的代谢机理是什么?)Chapter 9
20、DNA的生物合成一、DNA的复制:(一)过程:1、需要的酶:解链酶2、单链DNA结合Pr3、引物酶合成引物RNA,故是DNA指导的RNA聚合E4、DNA聚合酶 5、RNA酶核糖核酸E,水解掉RNA6、DNA连接酶,连接起来考点:1、酶作用的顺序,2、因子,E参及了DNA的复制(二)特点:(1)半保留复制(2)合成方向5端3端(3)模板DNA(4)主要E是DNA聚合酶,(5)什么依赖(指导)的XXE(6)原料:DNTP(7)产物DNA (8)DNA合成都需要引物,RNA合成都不需要引物。引物是为了在糖位原子上提供一个羟基,(8)衰老的端区学说合成一点,减少一点(不衰老CELL存在端粒酶,故DNA
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