北京林业大学研究生课程教学大纲汇编春节(中册).docx
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1、此京林业大巻研究或像程敖大纲汇編未考(中册研究丈院2015年07月18日目录第一部分生物学院13002033动物生殖生物学13002034统计遗传学43002035表观遗传学73002036 林木遗传育种方法93002037髙级遗传学综合大实验113002038功能性食品评价133002039发酵工程原理与技术153002040科学研究方法(专业硕士) 173002042植物组织培养193002043植物生物化学233002044植物分子生物学实验技术253002045微生物分子生物学及遗传学273002046现代环境微生物学303002047现代微生物学研究进展323002048微生物分子生
2、态学343002050高级细胞生物学363002051细胞生物学大实验383002052群体遗传学导论413002053进化遗传学453002054细胞遗传学483002055分子遗传学503002056植物激素分析技术523002057植物显微技术543002058植物生理大实验573002059植物生理生态学583002060植物发育生物学613002061食品加工过程安全专题(含案例分析)65第二部分 理学院67301101I复杂系统建模673011012生物物理学H693011013高等概率论与数理统计713011014高等随机过程733011015计算几何743011016偏微分方程
3、数值解763011017 数学 783011018凸几何引论803011019现代计算机代数823011020线性模型843011021智能优化方法及其应用 863011022模糊集理论及其应用883011023数值分析903011024 矩阵论933011025最优化方法及其風用953011026积分变换与数学物理方程97第三部分材料学院993005012林产化学加工专题993005013生物技术概论1013005014制浆造纸技术专论1033005015纳米材料概论1053005016生物质能源进展1073005017天然活性物质研究前沿1093005018现代制浆造纸技术11130050
4、19 咼等木材学 1133005020家具材料与结构1153005021木材功能性改良1163005022木质复合材料与胶粘剂 , , 1183005023木材机械加工技术1213005024工程木制材料学 1233005025家具产品研发1253005026家具艺设计1263005027 家具设计兄赛 1273005028家具文化研究1293005029实验数据分析与模拟130第四部分 工学院1323003022 7A牛结构 CAE 技术 1323003023业机器人及控制技术1363003024机器视觉1383003025最优控制原理与应用1403003026工程测试技术142300302
5、7计算机辅助设计1443003028林业与木工机械专论1473003029嵌入式系统设计1493003030线性系统理论1513003033人机工程专论1537003005现代操作系统编程155第五部分信息学院1573004012 iri息服务专题1573004013信息系统研究方法论1593004014 信息科学原理 1603004015高级信息系统1623004016图像处理算法及应用1643004017虚拟现实理论与算法1663004018分布式计算与大数据处理1683004020 咼级数据库技术 1703004023森林资源调查与信息自理1723004024 咼级软件测小1743004
6、025软件估算技术1767004003移动设计及开发178第六部分环境学院1813017013环境系统模型1813017014污泥处理与资源化利用新技术1843017017专业论文与专利撰写186第一部分生物学院College of Biological Sciences and Technology3002033动物生殖生物学Animal Reproductive Biology32学时(其中,讲授:32学时:实验:学时:实习:。学时);2学分一、课程简介课程性质;生殖是动物生长发育过程中的关键性环节,因此它是动物科学中的个重要组成部 分。生殖生物学是研究动物生殖的现象,揭示其规律,并在此基
7、础上研究生殖技术的一门学科,以 动物的解剖学、遗传学、生理学为基础,又和动物育种学、饲养学等密切联系。它是动物科学专业 的门专业基础课。教学目的:通过本课程的学习,使学生掌握动物生殖生理、繁殖技术、生殖障碍、生育评价 及提高生殖能力的方法,使学生逐步掌握理论结合实践的能力。为进步学习专业课以及在实际 作中能正确处理动物生殖问题,打下必要的理论和技术基础。主要内容:深刻理解、牢固掌握动物的生殖生理现象,包括对配子发生、性成熟、发情、受精、 妊娠、分娩和性行为等各种生殖现象的机理、内分泌的调节作用以及各种影响因素的论述和探讨: 生殖器官和生殖细胞的形态结构和生化特性的掌握:掌握发情控制、妊娠诊断、
8、胚胎移植等;熟练 掌握动物生殖力的评价、影响因素的分析和在生产管理中对提高生殖的讨论。二、预修课程及适用专业相关学科基础知识以动物生理学为重点,另外,与动物学、动物比较解剖学、动物组织与胚胎 学、发育生物学等课程有密切联系。本课程适用于动物学、野生动植物保护与利用、林学相关的硕士和博士研究生。三、课程内容及学时分配第一章生殖器官的结构与功能(2学时)第一节雄性生殖器官第二节雌性生殖器官第二章精子与精液(4学时)第一节精子发生第二节精子发生的调控机制第三节精子的成熟与获能第四节精液第三章雌性动物的发情周期(4学时)第一节卵泡的发育与卵子的发生第二节卵子成熟与排卵第三节发情周期第四节黄体的形成与退
9、化第四章受精与早期胚胎发育(2学时)第一节配子的运行第二节配子在受精前的准备第三节受精过程第四节早期胚胎发育第五章胚胎着床与妊娠(3学时)第一节胚胎着床第二节胚胎着床的分子调控第三节延迟着床第四节妊娠的识别 第五节胎膜和胎盘 第六节妊娠诊断 第六章分娩与泌乳(2学时) 第一节分娩的发动、预兆与过程 第二节乳腺的结构与发育 第三节泌乳的发动与维持 第四节排乳与哺乳第七章生殖激素(6学时) 第一节脑部生殖激素第二节性腺激素 第三节胎盘激素 第四节前列腺素 第六节其他激素与神经递质 第八章生殖行为与激素调节(4学时) 第一节控制生殖行为的神经内分泌系统 第二节雄性性成熟与生殖行为 第三节雌性性成熟与
10、生殖行为 第四节性周期及其影响因素第九章 生殖免疫(2学时) 第一节生殖细胞的免疫学特性 第二节妊娠期免疫第三节免疫与不育 第四节生殖激素与免疫 第十章辅助生殖与无性生殖(1学时) 第一节生殖缺陷第二节辅助生殖技术第三节自然条件下的无性生殖第四节人工辅助条件下动物的无性生殖 第H一章环境与生殖健康(1学时) 第一节物理、化学因素对生殖健康的影响 第二节生物因素对生殖健康的影响 第三节个人行为对生殖健康的影响 第十二章现代生殖生物学技术(1学时) 第一节细胞离体培养和操作第二节基因的克隆、表达检测与功能分析第三节微观形态学技术第四节研究的模式生物及选择四、教学方式及要求本课程教学环节主要为课堂讲
11、授。为提高学生的实践能力,充分掌握、灵活使用所学技术, 课堂教学以介绍各种方法的原理以及优缺点和适用性为重点,广泛介绍生殖生物学前沿知识以 及先进技术在本领域的应用,对于部分操作性理论知识,以视频内容向学生讲授,以加深对理 论知识的理解。五、考核办法根据选课研究生的专业方向特点,结合自己未来开展的论文方向撰写文献综述,使学生熟悉本 课程方法的具体应用,及其存在的不足课程论文的写作严格参照本领域核心期刊格式,加强对学 生获得信息、处理数据等多方面科研素质的培养。考核方式为考查。考核成绩分三部分:平时上课出席率占20%,课程作业占20%,结课论文占 60% 六、参考书籍及阅读文献资料教材:采用杨增
12、明,孙青原,夏国良主编,生殖生物学,科学技术出版社,2005;教学参考书:1动物繁殖学杨利国主编,中国农业出版社。2I动物生殖调控王建辰、章孝荣主编,安徽科学技术出版社。3I人类生殖学史小林主编,科学出版社。4I内分泌生理学迟素敏主编,第四军医大学出版社。5人类生殖生物学第三版导读版,Richard E. Jones & Kristin H. Lopez主编,科学出版社。6生殖内分泌学第五版,Jerome F. Strauss & Robert L. Barbieri主编,人民卫生出版社。开课单位:生物科学与技术学院 编写人:翁强审定人:翁强编写日期:2014-5-53002034统计遗传学S
13、tatistical Genetics32学时(其中,讲授:32 学时:实验:。学时;实习:学时);学分:2学分、课程简介现在生物技术发展已引发遗传学研究的革命性变化。在此背景下,利用合理的统计模型分析数 据、解释数据,并从中挖掘生物学规则是现代生物学研究的重要而紧迫的内容。本课程将针对林木 特性,讲授有关数量性状基因定位,组学数据分析、建模,基因网络构建等前沿内容。帮助没有统 计学背景的学生了解遗传数据分析的原理、方法与计算机软件;同时为没有生物学背景的学生提供 当今生物学研究的前沿领域。本课程是应用数学与现代生物学的交叉学科。二、预修课程及适用专业预修课程:1.数学分析2,数理统计3 .计
14、算机语言4 .基础遗传学适用专业:1 .林木遗传育种2 .生物信息3 .统计学4 .计算机科学5 .植物学6 .细胞生物学三、课程内容及学时分配1 .孟德尔遗传与连锁(讲课2学时)基本要求:要求掌握孟德尔遗传与连锁的基本概念:了解显性原则,分离定律(孟德尔第一定 律),以及自由组合定律(孟德尔第二定律)的定义及意义;掌握连锁机制与应用。2 .哈迪温伯格不平衡分析(讲课2学时)基本要求:要求掌握哈迪温伯格法则的概念;掌握复等位基因,性连锁基因,多基因座等基础 知识;了解不平衡原因与机理;明确法则的分析方法,应用于推广。3 .连锁不平衡分析原理(讲课3学时)基本要求:要求掌握连锁不平衡现象;了解分
15、析方法;可以独立举例说明;分析在连锁不平衡 程度的评估、复杂性状精细定位以及研究人类的历史和迁移中得到了越来越广泛的应用。4 .分子标记遗传图谱构造(讲课4学时)基本要求:掌握分子标记遗传学的应用方法:选择合适作图的DNA标记,根据遗传材料之间的 DNA多态性,选择用于建立作图群体的亲本组合;建立具有大量DNA标记处于分离状态的分离群体 或衍生系;测定作图群体中不同个体或株系的标记基因型;对标记基因型数据进行连锁分析,构建 标记连锁图;了解构建图谱的方法;掌握分析个别案例。5 .数量性状基因定位(讲课3学时)基本要求;掌握数量性状基因定位的概念及方法;讲解数量性状的遗传机理,表型值和表型方 差
16、;了解该种方法的应用范围及实例:学会该种方法并可以应用于实践。6 .功能定位(讲课4学时)基本要求:掌握功能定位的基本方法与定义;了解功能定位的应用;要求掌握功能定位定义域 方法:任何生物个体的发张过程都是个复杂的动态过程。传统的定位方法只能利用单个时间点的 表型数据,这对于整个发育过程的遗传调控过于简单。功能作图(Functional Mapping)是针对复杂 动态性状而提出的定位理论,其在解决多时间点测量的连续表型数据方面,可利用多种生长曲线来 解析复杂数量性状。7 .基因型X环境互作与上位性互作(上课3学时)基本要求:了解基本概念及分析方法:基因与环境互作这个概念用表型可塑性进行量化表
17、达。 基于这表达,把每组基因型的多环境表型数据,转换成一个由环境因子导向的连续纵向数据。表 型可塑性是生物个体对环境变化所表现出来的适应性,是生物进化的个有利因素。但是针对某个 生物性状,如何定量描述表型可塑性对环境的反应规则,如何定位其调控基因,一直是数量生物学 研究领域的热点问题。在此基础上,利用功能作图理论,定位那些对环境变化敏感的QTL。除加性 效应外,上位效应在数量性状变异种也较为普遍。传统观点认为量性状变异很大一部分都是由加性 效应造成,而忽视了上位互作的遗传效应。而上位效应可解释丢失遗传等现象。8 .基因表达数据聚类分析(上课3学时)基本要求:了解基因表达的含义;掌握分析表达数据
18、的方法;了解聚类的几种方法及比较;会 应用其中一种方法独立完成一项分析工作。9 .基因调控网络构建(上课2学时)基本要求:了解基因调控的概念及基本方法,学会构建网络联合分析的方法;掌握布尔网络模 型以及贝叶斯网络模型的机理和应用。10 .系统生物学与数量遗传学:系统定位(上课2学时)基本要求:了解系统生物学与数量遗传学的基本概念;了解两种学科的背景与关系;掌握系统 定位的含义;了解三者之间的关联。掌握系统生物学标记语言以及MathSBML的软件应用。11 .全基因组关联分析(上课2学时)基本要求:了解全基因组关联分析的背景,方法;基因组测序工作的完成,基于序列变异SNP 单体型图谱构建,高通量
19、基因分型技术的迅猛发展;一个反应监测成百上千个SNPs,不只局限与“候 选基因”,基因可以是“未知”的,GWA研究不再需要在研究之前构建任何假设。12 .统计遗传学展望(上课2学时)基本要求:过去的研究中,统计遗传学为全面系统研究复杂性状的遗传因素掀开了新的一页, 并为我们了解复杂性状的发生发展机制提供了丰富的线索。不过由于性状与基因之间的关系受很多 种因素的作用,因此,统计遗传学目前仍面临着些问题,如获得的结果似是而非,不能完全解释 某些病因等等。但是作为一种强有力研究工具,随着高通量测序技术、计算机技术的不断发展,以 及表观遗传学、数量遗传学、系统生物学、生理学等学科综合推进,作为一种综合
20、性的分析方法, 统计遗传学必将迎来个更广阔的发展空间。四、教学方式及要求课程讲授、案例分析、学生亲自推导公式、进行数据运算、强化各科概念、技能的掌握 五、考核办法采用考试方式,其标准如下:1 .出勤率(10%)2 .课外作业(每周一次)(30%)3.研究报告(60%)(1)书面报告(50%)(2)课堂报告(8分钟)(10%)六、参考书籍Rongling Wu, Chang-Xing Ma, George Casella (2007)Statistical Genetics of Quantitative Traits, SpringerNew York开课单位:北京林业大学生物科学与技术学院编
21、写人:郭荣领审定人:童春发编写日期:2014年5月28日3002035表观遗传学Epigenetics32学时(其中,讲授:32学时:实验:。L学时;实习:_Q_学时);2学分一、课程简介表观遗传学是指研究在基因序列不发生改变的情况下,生物通过调控基因表达所导致的性状表 现差异的知识体系。表观遗传学研究的重点是影响基因表达的调控机制,包括DNA甲基化、染色质 重塑、基因组印记、组蛋白共价修饰和非编码RNA等。通过该课程的学习,使学生了解并熟悉各种 表观遗传学的概念及研究方法,为学生从事表观遗传学的相关研究打下理论和方法基础。二、预修课程及适用专业无需预修,适用生物类相关专业。三、课程内容及学时
22、分配1、绪论(3学时)表观遗传学的概念;发展历史;表观遗传学的特点;表观遗传学机制;表观遗传学的发展现状 2、DNA甲基化(4学时)DNA甲基化概况,真核生物DNA甲基化分布模式,真核生物DNA甲基化修饰系统,DNA甲 基化与遗传物质的稳定性,DNA甲基化与基因表达调控,DNA甲基化与其他表观遗传修饰的关系。3、染色质重塑与表观遗传调控(3学时)染色质重塑概述,SWI/SNF复合物,NW!复合物,CHD复合物,1N080复合物,染色质重塑 模式和机制。4、组蛋白共价修饰(3学时)组蛋白修饰概述,组蛋白修饰前及相关复合物,组蛋白突变体及其修饰,组蛋白密码。5、RNA可变剪接的表观遗传学机制(3学
23、时)可变剪接的基本机制,转录与剪接同时进行的机制,可变剪接受RNA聚合前II延伸速率的控 制,可变剪接的表观遗传学机制。6、非编码RNA与基因调控(4学时)RNA干扰,siRNA的研究进展,piRNA的研究进展,长链非编码RNA的研究进展。7、假基因研究进展(3学时)假基因,探讨假基因的生物学意义,假基因的识别,假基因的进化,假基因的分布,假基因的 功能。8、表观遗传学研究实验技术简介(3学时)染色质免疫共沉淀技术,全基因组定位技术,体外组装核小体技术,核小体相位分析,DNA甲 基化分析技术,染色质DNA酶I高敏感位点的检测,体内DNA足迹法。9、表观遗传学相关数据库简介(3学时)核小体定位相
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